Le littoral ouest de Nusa Penida abrite certaines des eaux les plus claires de l'archipel indonésien, avec une visibilité dépassant régulièrement trente mètres entre avril et novembre.
L'île calcaire, séparée de Bali par le détroit de Badung de quinze kilomètres, se situe au confluent de l'océan Indien et du détroit de Lombok, créant des remontées d'eau riches en nutriments qui attirent les espèces pélagiques toute l'année. Crystal Bay tient son nom des conditions translucides produites par les alizés constants du sud-est qui poussent l'eau de surface au large, remplacée par des courants plus frais et riches en minéraux venus des profondeurs.
Manta Point, situé à la pointe sud-ouest de l'île près de Manta Bay, fonctionne comme une station de nettoyage où les raies mantas de récif se rassemblent pour se faire débarrasser de leurs parasites par de plus petits poissons. Les observations enregistrées surviennent lors d'environ quatre-vingts pour cent des visites durant la saison de juin à octobre, lorsque les efflorescences de plancton coïncident avec des mers plus calmes. Les raies, mesurant de trois à cinq mètres d'envergure, tournent selon des modèles prévisibles dans le sens inverse des aiguilles d'une montre à des profondeurs comprises entre cinq et douze mètres. Gamat Bay, abritée par une formation de falaises en fer à cheval au nord de Crystal Bay, sert d'habitat pépinière pour les jeunes requins à pointes noires et les tortues vertes qui nichent sur les plages du nord de l'île.
Le circuit de snorkeling de la côte ouest couvre généralement trois à quatre sites en fonction des conditions de marée et de houle, les bateaux partant du port de Toyapakeh ou de Buyuk. Le récif en pente de Gamat Bay descend progressivement jusqu'à dix-huit mètres, tapissé de coraux corne de cerf et de coraux tables qui ont substantiellement récupéré après l'épisode de blanchissement El Niño de 2016. Les biologistes marins de l'Université Udayana ont documenté quarante-trois espèces de coraux durs et plus de deux cents espèces de poissons de récif sur les sites de l'ouest lors d'une étude en 2023. Les plongées sur tombant à Crystal Bay révèlent des gorgones ancrées au calcaire vertical, tandis que les chenaux sableux de la baie abritent des raies pastenagues à taches bleues et occasionnellement des poissons-lunes océaniques pendant la période de remontée d'eau de juillet à septembre.
La force du courant varie considérablement entre les sites et les phases de marée. Manta Point connaît une dérive modérée lors des marées montantes, nécessitant une bonne capacité de nage, tandis que Gamat Bay reste assez calme pour les snorkelers débutants durant la majeure partie de la journée. Les frais d'entrée sur l'île de 25 000 IDR, collectés au port, soutiennent les opérations de patrouille marine et l'entretien des bouées d'amarrage à travers quatorze zones de snorkeling désignées, établies en 2019 pour éviter les dommages causés par les ancres aux formations coralliennes.
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